Mystery-аниматроники - особая группа аниматроников. Они умеют делать удивительные вещи: телепортироваться, проходить сквозь стены, гипнотизировать, колдовать. Их легко отличить от остальных по глазам с фиолетовыми зрачками. Они родом с Земли 13. Они были созданы злым духом, жаждущим завоевать все вселенные, из аниматроников, живших на Земле 13 (кроме Тутантомиуса), и они были вынуждены беспрекословно служить ему. В Спрингтрапимусе и Фредерике сидели когда-то души ФЧ, но они были освобождены. Когда они попали на Землю 2000000, где был Ученый Фредди, тот направил их на путь добра. После этого Mystery-аниматроники восстали против злого духа и победили его. (однако тот может воскреснуть)
После того, как они узнали о Демоническом Фредди, они пришли к нему и пытались его остановить, но тот убил их, однако позже их воскресили.
К ним относятся:
- Спрингтрапимус
- Фредерик
- Фреддинанд
- Боннито
- Чикалетта
- Фоксимильян
- Спарки
- Мистионет
- МистиЭндо
- Тутантомиус (не входит в состав команды)